در این پژوهشکده، بزرگترین دایرةالمعارف قرآنی در حال شکلگیری است و تا به حال حدود ۱۷ جلد از آن منتشر شده؛ همچنین بزرگترین فرهنگنامه قرآن کشور و صدها پروژه علمی دیگر مانند مرجعیت علمی قرآن کریم، قرآن و استشراق، سبک زندگی بر اساس آموزههای قرآن و اهل بیت(ع)، فرهنگ واژگان مشابه قرآن کریم، فرهنگنامه وجوه و نظایر، قرآن و عرفان، اعجاز قرآن با گرایش شبههپژوهی، فرهنگ قرآن، فقه القرآن، نظام سیاسی قرآن کریم، نظام اخلاقی قرآن کریم و نظام فرهنگی قرآن کریم را در دست اقدام دارد.
